De Chinese overheid heeft altijd veel waardering getoond voor het werk van Bourdrez. Maar ook na zijn dood is hij niet vergeten. François Bourdrez is symbool komen te staan voor de lange samenwerking tussen China en Nederland op het gebied van waterbouwkunde. Enkele voorbeelden:
Direct na het overlijden van Bourdrez werd op initiatief van de Chinese overheid het 'Bourdrez Memorial Scholarship Fund' ingesteld, dat ten doel had om Chinese studenten in Nederland te laten studeren. Door het uitbreken van de Tweede Wereldoorlog is dit vroegtijdig gestopt.
In 2005 werd er tijdens een Nederlandse handelsmissie onder leiding van minister van Verkeer en Waterstaat Karla Peijs aandacht besteed aan het leven en werk van Bourdrez. Voor die gelegenheid werd door de Nederlandse Ambassade in Beijing een boekje uitgegeven met teksten in zowel het Engels als het Chinees: François Bourdrez : a struggle against mighty rivers 1901-1939.
In 2015 herdacht het NHRI haar 80-jarig bestaan. Daarbij was aandacht voor de rol van Bourdrez in de oprichting van het NHRI en de lange samenwerking tussen China en Nederland op watergebied. Op 28 mei 2015 werd tijdens een Chinees-Nederlandse watertop een samenwerkingsovereenkomst getekend tussen NHRI, Rijkswaterstaat, TU Delft, waterinstituut IHE en kennisinstituut Deltares. Tevens werd in het bijzijn van enkele afgevaardigden van de familie Bourdrez een gedenksteen onthuld voor François Bourdrez en twee andere Nederlands ingenieurs, die bij de oprichting van het NHRI betrokken waren: Van den Heuvel en Alma. De gedenksteen was een initiatief van Roland van den Berg, oud-ambassadeur van Nederland in China (van 1986 tot 1992), en staat nu in het museum van het NHRI.
Het Financiëel Dagblad publiceerde naar aanleiding van de op 15 juni 2015 een lang artikel over watersamenwerking tussen China en Nederland met veel aandacht voor de rol van Bourdrez.
In 2016 noemde minister van Infrastructuur en Milieu Melanie Schultz van Haegen het jubileum van het NHRI en de gedenksteen in een speech in Beijing over watersamenwerking tussen China en Nederland.
Onthulling van de gedenksteen voor ingenieurs Bourdrez, Van der Heuvel en Alma. Met links Zhang Jianyun, president van het NHRI, midden Roderik Bourdrez (kleinzoon van Francois Bourdrez) en rechts Roland van den Berg (oud-ambassadeur). (foto van nhri.cn)